有过案底并非一定不能开无犯罪证明。
分析：无犯罪证明通常用于证明某人在一定时间内没有犯罪记录。案底一般指某人过去的犯罪记录，但这并不意味着其无法获得无犯罪证明，特别是当案底涉及的犯罪记录已超过法定查询期限或已被妥善处理时。
提醒：若因案底导致无法开具无犯罪证明，且该证明对您的生活或工作有重要影响，建议及时咨询专业律师以寻求解决方案。
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处理方式：
从法律角度看，处理有过案底但希望开具无犯罪证明的情况，主要有以下几种方式：一是申请法院出具无罪判决或犯罪记录消除证明；二是向公安机关申请查询并出具无犯罪记录证明，但需确保案底已不影响该证明的开具；三是通过法律途径申诉或复议，以纠正可能的错误记录。
选择方式时，需根据案底的具体情况、开具证明的用途及法律规定来决定。
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具体操作：
1. 若案底涉及的犯罪记录已超过法定查询期限，可直接向公安机关申请开具无犯罪记录证明，并附上相关证明材料。
2. 若案底虽存在但已得到妥善处理（如已服刑完毕、已接受处罚等），可向公安机关申请查询并说明情况，争取开具无犯罪记录证明。
3. 若认为案底记录存在错误或不当，可通过法律途径申诉或复议，要求纠正错误记录，并在纠正后申请开具无犯罪记录证明。
4. 在特殊情况下，如涉及国际交流或特定工作需求，可能需要通过法院出具无罪判决或犯罪记录消除证明，以满足特定要求。
请根据实际情况选择合适的操作方式，并咨询专业律师以确保操作的合法性和有效性。