非法运输烟草价值4万，已涉嫌犯罪，应依法处理。根据《中华人民共和国刑法》，非法运输烟草扰乱市场秩序，情节严重可判刑并处罚金。不及时处理，将面临法律制裁及经济损失。
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非法运输烟草常见处理方式为自首、配合调查或聘请律师辩护。选择处理方式时，应根据案情轻重、个人情况等因素综合考虑，以最大化维护自身合法权益。
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非法运输烟草应依法处理。具体操作：1. 若案情较轻，可主动自首并如实交代案情，争取从轻处理；2. 若案情复杂，应积极配合调查，说明情况；3. 在整个过程中，建议聘请专业律师进行辩护，以确保自身权益得到保障。